کتاب‌خانه آیت‌الله حکیم که در واقع بخشی از منزل او است، درسال 1375 ، توسط آیت‌الله حاج سیدمحمدتقی حکیم تأسیس شد.او روحانی مسجد جامع حصار بوعلی، استاد دانشگاه تهران و اهل شوشتر است. مساحت کتاب‌خانه 116 متر مربع است که 56 متر مربع مخزن کتاب و 60 مترمربع قرائت خانه است. این کتاب‌خانه در مهر سال 1379 ، زیر مجموعه آستان قدس رضوی شد و از آن پس آستان قدس رضوی مسئولیت اهدا و خرید کتاب را برعهده گرفته است.
کتاب‌خانه 15000 جلد کتاب در زمینه‌های مختلف دارد و مهم‌ترین ویژگی آن وجود کتاب‌های خطی نفیس، حدود 107 جلد نسخه خطی و 250 جلد کتاب‌های چاپ سنگی، با موضوعات دینی و ادبی است. در این کتاب‌خانه روزنامه و مجله نیز محدود عرضه میشود. وجود کتاب‌های درسی و کنکور در این کتاب‌خانه سبب شده مراجعه‌کنندگان بسیاری داشته باشد.